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xiaofeng281949 xiaofeng281949 父系單倍群N

【請教大神】看到一份最新的關(guān)于單倍群N分類的研究報告,值得參考,但是不知道怎么用于分析自己的數(shù)據(jù)并歸類

文章來源 https://arxiv.org/abs/1504.06463
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似乎介紹了一種全新的N單倍群分類的方式。然而這里有很多SNP不知道WeGene里是不是有分析到,是否可以用來判斷自己在新的分類體系里屬于多少。只有請教大神啦!!
2016-10-06 ? IP屬地中國
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10 個回復(fù)

我只有F3665+ f1774+ f2729+ v2047+。
@wang, 我的最終數(shù)據(jù)出來了。在數(shù)據(jù)里找到了匹配的SNP如下:
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Common N:
M231
M232
F2636
F3373
F963
F2999
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N2:
F2952
F2930

N2b:
F2569

P43 ??
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按照這里的描述,大概屬于N2b。不過奇怪的是我也有P43這個SNP。是不是N2的分類還可以再細化?謝謝.
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PS: 按照這里的分法,應(yīng)該我屬于N?F4201。
我是瞎猜的啦。。
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我現(xiàn)在的原始數(shù)據(jù)還沒有出來。還不知道怎么在原始數(shù)據(jù)里找位點,有沒有什么攻略介紹我可以先研究研究的呢?
wang - 哈佛醫(yī)學(xué)院、德國馬普所分子人類學(xué)博士后
不清楚N和O與逐鹿之戰(zhàn)的關(guān)系
嗯,嗯, 了解,謝謝@wang. 我現(xiàn)在的原始數(shù)據(jù)還沒有出來。還不知道怎么在原始數(shù)據(jù)里找位點,有沒有什么攻略介紹我可以先研究研究的呢?
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另外,我查閱了一些資料,N單倍群大概是在公元前4000年的時候逐漸被O單倍群取代成為東北亞的優(yōu)勢族群。有沒有可能所謂涿鹿之戰(zhàn)就發(fā)生在古老的N單倍群和O單倍群之間?然后這場戰(zhàn)爭醞釀出了龍山文化?
wang - 哈佛醫(yī)學(xué)院、德國馬普所分子人類學(xué)博士后
注意:WeGene展示的beta樹是根據(jù)現(xiàn)有ISOGG的樹http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpN.html來畫的拓撲結(jié)構(gòu),而genotype的位點卻多于現(xiàn)有ISOGG的N樹,所以沒有展示出的位點就要去你的原始數(shù)據(jù)里去查找了。
噢, 看起來我只有M231和P43兩個位點match??剖颐菜茝腗231到P43之間還有兩個位點我是沒有的,是不是?F1206, F2130, F3094, F3312, F3361, F3163, F3665, 這些我都沒有啊。
wang - 哈佛醫(yī)學(xué)院、德國馬普所分子人類學(xué)博士后
你是P43+啊,因為論文中沒有檢測L665這個位點,所以你在Figure Legend中找不到自己L665+的分類。
wegene藏龍臥虎啊,哈哈。

謝謝@wang的答復(fù)。我的問題在于我好像無法根據(jù)那篇文章里的分類方法把我歸類。不知道是不是我弄錯了。貼上我的突變位點。請指教一下吧。
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wang - 哈佛醫(yī)學(xué)院、德國馬普所分子人類學(xué)博士后
我是這篇論文的作者之一
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WeGene芯片涵蓋了論文中提到的SNP,你只需要到自己的祖源結(jié)果頁面,點擊beta樹,看上面的突變位點情況即可。

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