
原始數據的“綻放”(第二季)——非rs位點結果
一、概述
? ? 在“第一季”中,我只分析了含有rs號的578153個位點,還有18591個位點沒有rs號。我將原始數據中這18591個位置信息比對了2014年10月的數據庫,比對上了7073個位點,其中1054個有rs號,請wegene查證,可以不用w號了。
二、過程
? ? 做annovar的輸入格式文件,然后跑annovar注釋,7073行;篩選:外顯子、錯義突變、stopgain,剩下447行;僅保留隱性突變和顯性雜合,剩余83個位點;刪除東亞人高頻率,剩余4個位點,比對clinvar、HGMD、OMIM中...(待編輯)
? ? 在“第一季”中,我只分析了含有rs號的578153個位點,還有18591個位點沒有rs號。我將原始數據中這18591個位置信息比對了2014年10月的數據庫,比對上了7073個位點,其中1054個有rs號,請wegene查證,可以不用w號了。
二、過程
? ? 做annovar的輸入格式文件,然后跑annovar注釋,7073行;篩選:外顯子、錯義突變、stopgain,剩下447行;僅保留隱性突變和顯性雜合,剩余83個位點;刪除東亞人高頻率,剩余4個位點,比對clinvar、HGMD、OMIM中...(待編輯)
1 個回復
我占個沙發!
贊同來自:
要回復問題請先登錄或注冊