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guwei0001 guwei0001 祖源分析

常染色體admixture分析

wegene的常染分析是直接給出K值最大時(假如K=20)的結果,分得比較細。但是分得太細比較難解讀。
建議wegene能給出K=2\K=3\K=5等k值從小到大的結果,就像admixture分析那樣。
admixture分析就可以給出k值從小到大逐步細分的結果,這會好解讀一些。也可以看到各地人的南北、東西比例等。
比如:
K=2, 得出南、北血統比例
k=3, 得出北、東、西血統的比例
。。。。。。。依次類推。
而且會有多個漢族人和其他民族的對比,表示在一張圖上。
這次有個網友愿意幫忙做admixture分析,愿意的網友可以給我發郵件:[email protected], 我這邊轉發給他。
時間到10月28號為限。23andme和WEGENE的數據都可以。請注明地方和民族。
聲明:這不是廣告!對南、北血統比例等感興趣的可以加入,并郵件聯系。
2016-10-23 ? IP屬地中國
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4 個回復

費力科思 - WeGene勤雜工
我們很快會放出開源的R軟件包,讓有興趣的用戶自己折騰。
?
如果沒有好的參考數據集,光是修改K的數值,并不能得到你所介紹的結果,比如北,東,西~~~
回答wang:
網上有網友愿意做常染色體admixture分析,有常染數據的可以加入一起跑一次。純屬玩票,不是商業行為,可能就做這一次。
radmixture是不是也有類似的功能?
好主意

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