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包括我在內看到的五六份全基因組報告全都攜帶遺傳性胰腺炎突變,是檢測錯誤還是啥?

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2018-11-05 ? IP屬地中國
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遺傳性胰腺炎相關的prss1基因存在另一個同源基因prss2。hg19里的信息不全,使得常規流程mapping的時候應該是把實際對應prss2的序列算成prss1,導致出現對應clinVar里的位點 (clinVar里這個顯性遺傳位點最初不是高通量測序確定下來的,目前多數高通量測序數據里也mask了這一位點,因為可能是mapping導致的)。
等雙11買全序測之后才能來交流了
社區小助手 - 專治各項疑難雜癥
尊敬的用戶,您好:
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1.?遺傳性胰腺炎為常染色體顯性遺傳。疾病的表現程度有輕重不同,且由于臨床難以診斷的原因中國遺傳性胰腺炎的發病率數據不明確。
2. WeGene?檢測的位點在?clinvar?數據庫報道為致病位點。(Clinvar是由美國國家生物技術信息中心于2013年建立的核心數據庫,是臨床表型與基因型研究中常用的數據庫。)
3.?全基因組遺傳性胰腺炎項目中WeGene熱點突變在不同數據庫中的頻率有很大差異。例如?rs144422014?上的G位點,在dbsnp中可以查詢到該變異在ExAC(外顯子測序)數據庫中的頻率為3.54% ,?而在TOPMED(全基因組測序)數據庫中的頻率高達29.5%。
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WeGene?全基因組測序使用的是目前行業內認可度最高的best practice?流程,加上頻率與全基因組數據庫TOPMED一致,因此我們暫時保持目前的結果展示。我們會隨時關注每個項目的科學新進展,適時對項目進行更新。感謝您的監督。
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祝好!
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對于遺傳性胰腺炎我的理解是這是read mapping和解讀的問題。
如果mapping到hg38d1以后的版本里,遺傳性胰腺炎相關prss1的這個位點應該就不會頻繁出現了。
不知道wegene未來會不會還提供mapping更新呢?
為什么上面的幾條合并在一起發系統就會說內容不合格呢?只有分開發了。
標準版,線粒體遺傳性非綜合耳聾一個突變。。
遺傳性胰腺炎突變我也中招了
tokyo9pm - “Jawatsau” toipu kunino tsatuma-paritsau no khoh'ei. Pukhei to mbokhei tsotsen pa ndottimo Namutohkhei.
我也是,攜帶一個突變
完了,剛看了看攜帶兩個突變,不能胡吃海塞了。

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