亚洲精品午夜精品,日本二手网站,国产AⅤ爽AV久久久久成人社区,日本一二三区不收费av

使用 WeGene 需要啟用 Cookies, 請啟用后刷新頁面獲得更好的體驗
yhlhhhhh yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂 祖源分析

直接利用G25坐標畫出PCA散點圖

編程語言:python3.x
模塊:
numpy
sklearn
matplotlib
可選:
jupyter notebook
整體思路:將G25給出的25維坐標降維并畫圖
二維PCA散點圖
代碼如下圖所示:

截屏2021-06-14_下午2.36_.04_.png

?
1. 先把自己手中的G25坐標數據集整理成csv
2. 讀取csv文件(此處我直接用的numpy模塊讀取,用csv模塊或pandas也可)
3. 將讀取的數組利用sklearn降維(此處的n_components表示降維后的維度,既然是二維圖,所以是2)
4. 用matplotlib模塊畫散點圖
展示結果:

截屏2021-06-14_下午2.37_.33_.png

?
三維PCA散點圖
步驟與二維類似,只是需要把n_components改成3,然后matplotlib部分需要畫三維圖
展示結果:

截屏2021-06-14_下午2.52_.30_.png

?
(代碼我已經放在附件里,大家可以下載使用)
2021-06-14 ? IP屬地北京
按熱門排序    按默認排序

5 個回復

yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂
我把這個帖子寫到CSDN上了,上面還有怎么看降維后坐標,有興趣的可以看看:
我用#CSDN#這個app發現了有技術含量的博客,小伙伴們求同去《利用G25祖源計算器坐標畫PCA散點圖》, 一起來圍觀吧 https://blog.csdn.net/yhlhhhhh/article/details/117919392?utm_source=app&app_version=4.9.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen
太優秀了
yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂
另外記得,如果電腦上沒有python一定要下python,記得下pip包管理工具,然后安裝模塊。
安裝模塊方法:
1. windows系統:打開命令行工具 ? ? Mac:打開終端
2.在里面輸入以下命令:
pip3 install numpy
pip3 install sklearn
pip3 install matplotlib
如果安裝模塊過程中下載速度很慢:
輸入以下命令:
pip3 install numpy -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip3 install sklearn -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip3 install matplotlib -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
?
west - 早知道基因,早做健康管理哈
竟然還提供代碼??
厲害了
技術貼

要回復問題請先登錄注冊

  • <track id="ffr4e"></track>

      <dfn id="ffr4e"></dfn>

      主站蜘蛛池模板: 湘潭县| 清徐县| 北流市| 东方市| 杭锦后旗| 孟津县| 东阳市| 吉木萨尔县| 中江县| 仙桃市| 平遥县| 泉州市| 松潘县| 军事| 扬州市| 桐乡市| 襄城县| 永兴县| 台南市| 冀州市| 开远市| 德保县| 城步| 革吉县| 成武县| 崇礼县| 西乡县| 昌图县| 株洲市| 儋州市| 元朗区| 屯门区| 武川县| 辽阳县| 仪征市| 万年县| 和顺县| 灯塔市| 四川省| 磐安县| 日喀则市|