亚洲精品午夜精品,日本二手网站,国产AⅤ爽AV久久久久成人社区,日本一二三区不收费av

使用 WeGene 需要啟用 Cookies, 請(qǐng)啟用后刷新頁(yè)面獲得更好的體驗(yàn)
yhlhhhhh yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂 祖源分析

直接利用G25坐標(biāo)畫(huà)出PCA散點(diǎn)圖

編程語(yǔ)言:python3.x
模塊:
numpy
sklearn
matplotlib
可選:
jupyter notebook
整體思路:將G25給出的25維坐標(biāo)降維并畫(huà)圖
二維PCA散點(diǎn)圖
代碼如下圖所示:

截屏2021-06-14_下午2.36_.04_.png

?
1. 先把自己手中的G25坐標(biāo)數(shù)據(jù)集整理成csv
2. 讀取csv文件(此處我直接用的numpy模塊讀取,用csv模塊或pandas也可)
3. 將讀取的數(shù)組利用sklearn降維(此處的n_components表示降維后的維度,既然是二維圖,所以是2)
4. 用matplotlib模塊畫(huà)散點(diǎn)圖
展示結(jié)果:

截屏2021-06-14_下午2.37_.33_.png

?
三維PCA散點(diǎn)圖
步驟與二維類(lèi)似,只是需要把n_components改成3,然后matplotlib部分需要畫(huà)三維圖
展示結(jié)果:

截屏2021-06-14_下午2.52_.30_.png

?
(代碼我已經(jīng)放在附件里,大家可以下載使用)
2021-06-14 ? IP屬地北京
按熱門(mén)排序    按默認(rèn)排序

5 個(gè)回復(fù)

技術(shù)貼
west - 早知道基因,早做健康管理哈
竟然還提供代碼??
厲害了
yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂
我把這個(gè)帖子寫(xiě)到CSDN上了,上面還有怎么看降維后坐標(biāo),有興趣的可以看看:
我用#CSDN#這個(gè)app發(fā)現(xiàn)了有技術(shù)含量的博客,小伙伴們求同去《利用G25祖源計(jì)算器坐標(biāo)畫(huà)PCA散點(diǎn)圖》, 一起來(lái)圍觀吧 https://blog.csdn.net/yhlhhhhh/article/details/117919392?utm_source=app&app_version=4.9.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen
yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂
另外記得,如果電腦上沒(méi)有python一定要下python,記得下pip包管理工具,然后安裝模塊。
安裝模塊方法:
1. windows系統(tǒng):打開(kāi)命令行工具 ? ? Mac:打開(kāi)終端
2.在里面輸入以下命令:
pip3 install numpy
pip3 install sklearn
pip3 install matplotlib
如果安裝模塊過(guò)程中下載速度很慢:
輸入以下命令:
pip3 install numpy -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip3 install sklearn -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip3 install matplotlib -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
?
太優(yōu)秀了

要回復(fù)問(wèn)題請(qǐng)先登錄注冊(cè)

  • <track id="ffr4e"></track>

      <dfn id="ffr4e"></dfn>

      主站蜘蛛池模板: 山丹县| 万源市| 九江县| 定远县| 新乡县| 东宁县| 子长县| 元阳县| 遂川县| 中阳县| 板桥市| 横峰县| 镇雄县| 兰州市| 香河县| 大丰市| 平度市| 江源县| 阿巴嘎旗| 宜良县| 米泉市| 衡南县| 遂溪县| 诸暨市| 陵水| 惠水县| 石城县| 健康| 汉寿县| 石楼县| 太原市| 新津县| 五台县| 邹城市| 明星| 皋兰县| 金川县| 鲁甸县| 淄博市| 同心县| 湘阴县|